Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms