Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms