Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms