Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc28a3Q9ERH8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms