Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms