Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP79

Vmn1r52, Vomeronasal type-1 receptor 52, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r52Q9EP79 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r52Q9EP79 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r52Q9EP79 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r52Q9EP79 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vmn1r52Q9EP79 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r52Q9EP79 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms