Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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