Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCQ7

Serpina1f, Alpha-1-antitrypsin 1-6, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1fQ9DCQ7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Serpina1fQ9DCQ7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpina1fQ9DCQ7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms