Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop7Q9DCH2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop7Q9DCH2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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