Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Hmg20aQ9DC33 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Hmg20aQ9DC33 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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