Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms