Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAF1

1700012A03Rik, RIKEN cDNA 1700012A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700012A03RikQ9DAF1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
1700012A03RikQ9DAF1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms