Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD9

H2al1m, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1mQ9DAD9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1mQ9DAD9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1mQ9DAD9 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms