Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms