Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efhc1Q9D9T8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efhc1Q9D9T8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms