Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp12Q9D9M2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms