Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt1Q9D9J3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt1Q9D9J3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms