Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnot8Q9D8X5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnot8Q9D8X5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms