Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6K8

Fundc2, FUN14 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc2Q9D6K8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fundc2Q9D6K8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fundc2Q9D6K8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms