Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr42e1Q9D665 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.4 ms