Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms