Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zc2hc1bQ9D534 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Zc2hc1bQ9D534 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms