Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubgcp4Q9D4F8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms