Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms