Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rufy3Q9D394 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms