Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krtap5-3Q9D226 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krtap5-3Q9D226 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krtap5-3Q9D226 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krtap5-3Q9D226 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krtap5-3Q9D226 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krtap5-3Q9D226 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krtap5-3Q9D226 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krtap5-3Q9D226 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krtap5-3Q9D226 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krtap5-3Q9D226 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krtap5-3Q9D226 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms