Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1F3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1F3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q9D1F3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D1F3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms