Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hddc3Q9D114 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms