Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp11Q9CZJ1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms