Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nde1Q9CZA6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nde1Q9CZA6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms