Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo5Q9CXP9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo5Q9CXP9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo5Q9CXP9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo5Q9CXP9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo5Q9CXP9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo5Q9CXP9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo5Q9CXP9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo5Q9CXP9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo5Q9CXP9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo5Q9CXP9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo5Q9CXP9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo5Q9CXP9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo5Q9CXP9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Exo5Q9CXP9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Exo5Q9CXP9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Exo5Q9CXP9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Exo5Q9CXP9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Exo5Q9CXP9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Exo5Q9CXP9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Exo5Q9CXP9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Exo5Q9CXP9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Exo5Q9CXP9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Exo5Q9CXP9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Exo5Q9CXP9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Exo5Q9CXP9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Exo5Q9CXP9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Exo5Q9CXP9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Exo5Q9CXP9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms