Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Utp23Q9CX11 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms