Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otud1Q9CUB6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms