Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms