Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atp13a2Q9CTG6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms