Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ska2Q9CR46 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms