Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR35

Ctrb1, Chymotrypsinogen B, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctrb1Q9CR35 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Ctrb1Q9CR35 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ctrb1Q9CR35 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ctrb1Q9CR35 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ctrb1Q9CR35 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ctrb1Q9CR35 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ctrb1Q9CR35 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ctrb1Q9CR35 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ctrb1Q9CR35 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ctrb1Q9CR35 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ctrb1Q9CR35 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ctrb1Q9CR35 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctrb1Q9CR35 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms