Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Higd2aQ9CQJ1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms