Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpb2Q9CQI7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms