Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700129C05RikQ9CQ77 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms