Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms