Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc18Q9CQ07 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms