Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ska1Q9CPV1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms