Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acss1Q99NB1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms