Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mccc1Q99MR8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mccc1Q99MR8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms