Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins4Q99LZ3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms