Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms