Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms