Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms