Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf19Q99KP6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms